研究人员提出了一种简便的尿液蛋白质组综合分析策略

尿液是早期和敏感生物标志物发现的有吸引力的来源之一，因为它可以在非侵入性收集的同时积累并反映人体的变化。然而，由于尿液蛋白质组的动态范围很宽，蛋白质浓度跨越大约 10 个数量级，因此对尿液蛋白质组的分析提出了挑战。

尿液中高丰度蛋白质的存在会掩盖潜在的疾病生物标志物，使其难以识别。在进行质谱 (MS) 分析之前，通常采用分馏和耗尽策略，以增强对这些难以捉摸的生物标志物的检测和识别。

作为一种有前途的替代方法，通过超速离心 (UC) 进行的尿液分馏可用于去除高丰度蛋白质，从而分离出高纯度的外泌体，同时保留上清液中的大部分高丰度蛋白质。尽管如此，UC 期间强大的离心剪切力不可避免地会破坏外泌体的完整结构，导致仅从少量尿液中分离出微量的外泌体。

考虑到所有现有的局限性，中国的一组研究人员提出了一种基于固相烷基化 (SPA) 的新型样品制备方法，用于亚微克蛋白质组样品的低损耗、抗干扰处理。该团队在尿液杂志上报告了他们的研究。

“我们的方法结合了 UC 分馏、固相萃取 (SPA) 样品制备和液相色谱-质谱(LC-MS)，以实现尿液的综合蛋白质组分析，称为 CPU，或尿液的综合蛋白质组分析，”相应的解释说作者袁惠明，中国科学院大连化学物理研究所研究员。“这种简便的策略导致使用大约一小时的短 LC 梯度鉴定了总共 1,659 种蛋白质，这是从未经分馏的原始尿液中鉴定的 730 种蛋白质的 2.3 倍。”

值得注意的是，与现有的尿样制备方法相比，CPU 具有显着的优势。不仅将分析时间大幅缩短了 3-4 倍，而且将尿液蛋白质组的识别覆盖率提高了 130%-160%。

“该方法进一步与无标记定量相结合，对 IgA 肾病 (IgAN) 患者和健康供体的尿液进行比较蛋白质组分析，”主要作者、中国科学院大连化学物理研究所技术人员刘新新说。科学。“结果，鉴定出了 227 种差异表达的蛋白质，揭示了与 IgAN 相关的潜在生物标志物。”

发现溶质载体家族 22 (SLC22) 的几个成员在 IgAN 患者中上调，表明与这些个体的肾代谢功能破坏存在潜在联系。

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